در سال 1389با پیشنهاد و پیگیری ریاست وقت دانشگاه (آقای دکتر لاریجانی) تاسیس و تشکیل «معاونت فرهنگی» با هدف مدیریت و برنامه ریزی امور فرهنگی مربوط به کارکنان دانشگاه (اعضای هیئت علمی و غیر هیئت علمی) و نیز ایجاد هماهنگی بین واحد های اجرایی فرهنگی به تصویب رسید و آقای دکتر محسن پرویز به عنوان اولین معاون فرهنگی دانشگاه مسئول تشکیل و مدیریت این معاونت شد.
در سال 1395 با تشکیل معاونت اجتماعی در وزارت بهداشت این معاونت اقدام به تصویب تشکیلات «معاونت اجتماعی» در دانشگاه های علوم پزشکی به عنوان تشکیلات متناظر نمود و در پی ابلاغ آن به دانشگاه مقرر شده این تشکیلات به «معاونت فرهنگی» الحاق و نام آن به «معاونت اجتماعی فرهنگی» تغییر یابد و همزمان با این تحولات آقای دکتر عبدالرحمن رستمیان مسئولیت این معاونت را بر عهده گرفت.
در سال1398 با حذف «معاونت اجتماعی» در وازرت بهداشت، «معاونت اجتماعی فرهنگی» دانشگاه نیز مجدداً به «معاونت فرهنگی» تغییر نام یافت. با حکم ریاست دانشگاه آقای دکتر رستمیان بعنوان معاون فرهنگی و مشاور ریاست دانشگاه در امور اجتماعی کماکان مسئولیت این معاونت را برعهده دارند.
هم اکنون این معاونت با دو مدیریت «امور فرهنگی» و «مشارکت های مردمی» در دانشگاه فعالیت می کند. دبیرخانه سلامت و امنیت غذایی استان نیز در معاونت فرهنگی مستقر شده است. اهم وظایف معاونت فرهنگی به شرح زیر می باشد:
تبیین و ترویج فرهنگ اسلامی ایرانی در دانشگاه
تبیین و ترویج اخلاق حرفه ای با محوریت اخلاق اسلامی در دانشگاه
تقویت بینه فرهنگی و هنری دانشگاهیان با هدف خلق آثار فاخر در حوزه سلامت
تقویت و پشتیبانی از تحقیق و پژوهش های فرهنگی در دانشگاه
توسعه مشارکت های فرهنگی و اجتماعی دانشگاه با سایر سازمان ها و نهاد ها
بهره گیری از توان بالقوه داوطلبین مردمی و خیرین داخل و خارج از دانشگاه برای ارائه خدمات سلامت به نیازمندان و ارتقاء فرهنگ خدمات داوطلبانه و مؤمنانه
انجام وظایف و فعالیتهای دبیرخانه کارگروه سلامت و امنیت غذایی استان در راستای اجرای برش استانی مصوبات شورای سلامت و امنیت غذایی کشور و مشارکت بین بخشی در جهت اجرای مصوبات کارگروه ساغ و نظام نامه سلامت استان
